Lối chơi bắn súng trong Bubble Fighter có thể coi là dạng "độc nhất" so với các tựa game bắn súng hiện nay, khi không chỉ phải bắn hạ đối thủ, người chơi còn phải lại gần để "đập nổ bong bóng" thì mới có thể thực sự kết liễu.